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操作步骤:
1. 在适当大小的离心管中将1体积的全血与5体积的Buffer EL混合。
为了获得最佳结果,混合物的体积(血液+Buffer EL)不应超过离心管体积的3/4,以实现有效混合。例如,将5ml Buffer EL加到1ml全血中,并混入总体积为8ml以上的离心管中
注意:使用适量的全血。最多可处理1.5ml健康血液(通常每微升全血有4000-7000个白细胞)。如果使用白细胞数量增加的血液,则适当减少剂量。(在这种情况下,还要在步骤6中调整Buffer RLT的数量。)
2. 在冰上孵育10–15min。在孵育过程期间短暂涡旋2次以充分混匀。
在孵育过程中混浊的悬浮液变为半透明,表明红细胞溶解。如有必要,孵育时间可延长至20min。
3. 在4°C下以400×g离心10min,然后完全去除并丢弃上清液。
离心后白细胞将形成沉淀,确保上清液完全清除。残留痕量红细胞会使沉淀呈红色,这在随后洗涤步骤中将消除。
4. 将Buffer EL加到细胞沉淀中(根据步骤1所用血液体积计算,按每体积全血使用2体积Buffer EL)。通过短暂涡旋重悬细胞。
例如,对于在步骤1中使用1ml全血,则此步骤添加2ml Buffer EL。
5. 在4°C下以400×g离心10min,然后完全去除并丢弃上清液。
注意:上清液的不完全去除会干扰裂解以及随后的RNA与核酸吸附柱的结合,从而导致收率降低。
6. 按下表将Buffer RLT(使用前请检查Buffer RLT是否加入β-巯基乙醇)添加到沉淀的白细胞中,充分混匀涡旋30s混匀。
当使用非健康血液时,请参考白细胞的数量来确定所需的Buffer RLT的体积。Buffer RLT破坏细胞。 在继续进行均质化步骤之前,应该看不到任何细胞团块。若有细胞团块,则涡旋或移液吹打以清除。
Buffer RLT (µl)
Healthy whole blood (ml)
No. of leukocytes
350
Up to 0.5
Up to 2× 106
600
0.5 to 1.5
2× 106 to 1× 107
7. 将步骤6中混匀后的溶液转移入过滤柱中,最大转速(~13,400×g)离心2min,丢弃过滤柱,收集滤液。
注意:为避免气溶胶的形成,请将移液器调整到≥750µl以保证一次性将所有溶液转移到过滤柱上,如果细胞太多,将会出现裂解液粘稠的现象,造成难以吸取的情况。
8. 向滤液中加入1倍体积70%乙醇(通常为350μl或600μl),并通过移液器吹打混匀(不要涡旋)。将得到的溶液一起转入吸附柱中(吸附柱提前放入收集管中),≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。
加入乙醇后可能会形成沉淀,这不会影响后续的提取程序。吸附柱最大上柱量为700μl,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明则吸附柱均置于2ml收集管中。若不需进行DNase I消化则继续步骤11。
9. (可选步骤)向吸附柱中央加入80μl DNase Ⅰ工作液,室温(15℃-25℃)静置15min。配制DNase Ⅰ工作液:取10μl DNase Ⅰ储备液入新的RNase-free离心管中,并加入70μl Buffer RDD,轻柔混匀。
注意:DNase Ⅰ对物理变性特别敏感,所以混匀时请上下倒置轻柔混匀,切勿涡旋。请确认DNase Ⅰ工作液加入到正中央的柱膜上,否则DNase消化效果会不理想。
10. 向吸附柱中加入700μl Buffer RW1,≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。
11. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μl Buffer RPE(使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。
12. 重复步骤11一次。
13. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中,以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱膜。
14. 将吸附柱套入新的无酶1.5ml离心管管中,并置于无酶的环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。
若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。
15. 向吸附柱膜正中央加入50-100μl RNase-free Water,盖上盖子室温静置3-5 min。后置于离心机中≥12,000×g(≥13,000 rpm)离心3min得到RNA溶液。
RNA洗脱体积不应少于30μl,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应置于-82℃储存。