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操作步骤:
1. 根据样品类型进行以下操作:
1a:哺乳动物全血、白细胞层、培养细胞
(1)取200μl样本(如果样本为培养细胞则细胞数应在104-106之间,离心后用PBS重悬)入1.5ml无酶离心管中,加入200μl Buffer BB和20μl Proteinase K Solution,立即混匀并在70℃孵育10-15min。
样本总量达不到200μl时可加PBS补至200μl。
(2)选做:加入5μl 20mg/ml RNA酶,上下颠倒混匀,37℃或室温孵育5-10min。
(3)向离心管中加入100μl异丙醇混匀,进行步骤2。
1b:哺乳动物组织或鼠尾
(1)取25-50mg样本入1.5ml无酶离心管中,加入200μlTissue Lysis Buffer和20μl Proteinase K Solution,立即混匀并在55℃下孵育1h直至组织完全消失,鼠尾组织需延长孵育时间至3h或更长。
孵育前可将样品剪成小块或用研磨杵/电动研磨机破碎组织,可增加核酸产量。
孵育完后使用1ml无针头的一次性注射器吹打溶液3-5次以剪切溶解的鼠尾样本可提升核酸产量。
(2)加入200μl Buffer BB立即混匀并在70℃孵育10-15min。
鼠尾样品无需70℃孵育。
(3)选做:加入5μl 20mg/ml RNA酶,上下颠倒混匀,37℃或室温孵育5-10min。
(4)向离心管中加入100μl异丙醇混匀。如若为鼠尾样品则无需进行步骤(5),13,000×g离心5min,取上清直接进行步骤2。
(5)用移液器装载1ml枪头吸取溶液,这时候如若吸取到不溶的组织颗粒并阻塞枪头,将枪头连同不溶物取出溶液中,并将其丢弃,进行步骤2。
1c:真菌细胞或细菌细胞
(1)取200μl真菌或细菌溶液,3,000×g离心5min,去除上清,加入200μl PBS重悬细胞。
(2)对于真菌细胞:加入10μl5000U/ml破壁酶溶液(Lyticase Solution)至溶液中,充分涡旋混匀15-20s后37℃孵育30-60min。
对于细菌细胞:加入30μl50mg/ml溶菌酶溶液(Lysozyme Solution)至溶液中,充分涡旋混匀15-20s后37℃孵育15-30min。
(3)加入200μl Buffer BB和20μl Proteinase K Solution,立即混匀并在70℃孵育10-15min。
(4)选做:加入5μl 20mg/ml RNA酶,上下颠倒混匀,37℃或室温孵育5-10min。
(5)向离心管中加入100μl异丙醇混匀,进行步骤2。
1d:FFPE组织切片
(1)将FFPE组织切片放入二甲苯中脱蜡约30min。
脱蜡时间取决于切片厚度。
(2)通过分级乙醇处理将组织切片再水化:无水乙醇中放置10s;80%乙醇中放置10s;60%乙醇中放置10s;40%乙醇中放置10s;超纯水中放置10s。
(3)在显微镜下观察切片,并用手术刀从再水化切片中切割所需的组织区域,确定样本重量在25-50mg之间,将样品转移到无酶的1.5ml微离心管中。
(4)加入200μlTissue Lysis Buffer和20μl Proteinase K Solution,立即混匀并在37℃孵育过夜。
(5)再加入20μl Proteinase K Solution,立即混匀并在55℃孵育1-2h。
(6)加入200μl Buffer BB,彻底混匀并在70℃孵育10-15min。
(7)选做:加入5μl 20mg/ml RNA酶,上下颠倒混匀,37℃或室温孵育5-10min。
(8)向离心管中加入100μl异丙醇混匀。
(9)用移液器装载1ml枪头吸取溶液,这时候如若吸取到不溶的组织颗粒并阻塞枪头,将枪头连同不溶物取出溶液中,并将其丢弃,进行步骤2。
2. 把吸附柱套在2ml收集管中。将上个步骤所得溶液加入柱中,8000×g离心1min。离心完后倒掉收集管中的废液。
如果出现堵柱现象,则将吸附柱(套在2ml收集管中)再次全速离心1min直至溶液全部过柱。
3. 向吸附柱中加入500μl BufferIRB,8000×g离心1min,离心完后倒掉收集管中的废液。
4. 向吸附柱中加入500ul Buffer WB(已加入无水乙醇),8000×g离心1min,离心完后倒掉收集管中的废液。
5. 重复操作步骤4一次。
6. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,12000×g离心2min以除尽Buffer WB。将吸附柱套入新的1.5ml无酶离心管中并置于室温放置5-10min彻底晾干乙醇。
注意:BufferWB中的乙醇残留会影响后续的酶反应实验。
7. 向吸附柱膜中间位置悬空滴加50-100μl70℃预热Buffer EB,室温静置2min后12000×g离心2min收集核酸溶液。丢弃柱子,盖上离心管盖子置于-20℃保存。
注意:洗脱体积不应小于30μl,体积过少影响回收效率。70℃预热Buffer EB能提高核酸的回收量。为了提高核酸的回收量,可将离心得到的溶液重新加回离心吸附柱中按步骤9方法再次离心收集核酸。