商家描述
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操作步骤:
1. 取180-220mg的粪便放入2ml离心管中(未提供)中,并将该管放置在冰上等待使用。后续所有操作应在室温下进行。
当样品少于180mg也可正常进行。在使用少量的粪便时,不需要减少缓冲液的量。如果样品为液体,则将样品量改为200μl(用剪去尖部的枪头能更好的吸取);如果样品为冷冻的粪便,则用手术刀切取180-220mg,注意在使用冷冻粪便时应避免样品在步骤2加入Inhibit EX Buffer前解冻,这会使DNA降解。
2. 在每个粪便样品中添加1ml InhibitEX Buffer,涡旋1min或直到样品完全混匀。
彻底涡旋样品很重要,这有助于确保最终洗脱液中的获得最多DNA。
3. 在70℃下水浴加热5min,期间可适当涡旋2-3次,每次涡旋约15s。
对于难以裂解的细胞如革兰氏阳性菌,可适当提高温度至95℃。本步骤主要用于粪便中病原微生物提取,若提取的目的主要是为了粪便物种自身的基因组则须忽略此步骤。
4. 最大转速 (~13,400×g)离心3min以沉淀颗粒物,吸取200μl上清液转移至新的2ml离心管中。
转移上清液时应避免吸到任何固体颗粒,如果上清中仍有可见颗粒,应再次离心样品。
5. 在装有200μl上清液的离心管中加入15µl Proteinase K溶液。再加入200μl Buffer AL并涡旋15s使溶液混匀。
注意:Proteinase K溶液不能与BufferAL先混合,需先后混匀加入。Buffer AL与样品需完全混匀。
6. 70℃下水浴加热10min。
7. (可选步骤)若需去除RNA,加入10µl RNaseASolution(20mg/ml)至溶液中,混匀后室温静置10min。
8. 向离心管中加入200μl的无水乙醇,涡旋混匀。
9. 将上述混匀的溶液转移至吸附柱上,盖上盖子,最大转速 (~13,400×g)离心1min。
如果溶液未完全通过吸附柱,则再次离心直至全部溶液通过吸附柱。
10. 倒弃流出液,把柱子重新装回收集管中。加入500μl BufferAW1(请先检查是否已加入无水乙醇)至柱子上并以12,000rpm离心1分钟。
11. 倒弃流出液,把柱子重新装回收集管中。加入500μl BufferAW2(请先检查是否已加入无水乙醇)至柱子中,12,000rpm离心1分钟。
12. 重复操作步骤11一次。
13. 倒弃流出液,把柱子重新装回收集管中。最大转速 (~13,400×g)离心空柱2分钟,以甩干柱子的残留物质。(这一步要尽量提高离心速度以减少乙醇的残留)。
注意:乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验,彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
14. 将柱子转移至新的1.5ml无菌的离心管,敞开盖子室温静置10min以彻底晾干漂洗液。
15. 加入30~100µl预热至70ºC的Buffer ATE至柱子的膜中央,静置2分钟后以最大转速 (~13,400×g)离心2分钟收集离心下的基因组DNA。
16. 弃去柱子,将基因组DNA溶液于-20℃保存(短期可保存2-8℃)或进行下游实验。