KASP基因分型检测
技术原理:
以SNP分型检测为例,在PCR过程中,两个探针能与正向引物和反向引物之间的互补序列特异退火结合。当探针以完整形式存在时,由于能量共振转移,荧光基团只发出微弱荧光。特异的探针与相应的等位基因杂交后,DNA聚合酶发挥5’外切酶活性,把报告荧光基团切割下来,从而发出荧光;而SNP探针的错配形式不会引起切割,无荧光信号。MGB分子结合到DNA螺旋小沟,通过稳定MGB探针/模板提高杂交稳定性,使短至13个碱基的探针获得高错配区分辩别能力。MGB探针包括一个不发荧光的淬灭基团(NFQ),极大消除传统淬灭基团产生的背景荧光,提高信噪比,从而提高检验灵敏性。
KASP基因分型检测:
GN21261 | KASP引物设计合成验证 |
GN21262 |
碱裂解法基因组DNA提取 |
GN21263 |
KASP基因分型检测(位点>1M) |
GN21264 |
KASP基因分型检测(200K-1M) |
GN21265 |
KASP基因分型检测(50K-200K) |
GN21266 |
KASP基因分型检测(20K-50K) |
GN21267 |
KASP基因分型检测(5K-20K) |
GN21268 |
KASP基因分型检测(2K-5K) |
技术特点:
1. 适合位点少,样本通量高的检测,每个位点需要合成一对探针,探针合成费用高;
2. 应用实时荧光定量PCR仪进行定量检测;
3. 操作简便,只需一步 PCR 反应,无须纯化和预处理,直接上机检测;
4. 结果清晰,软件分析结果界面友好,标出每个样本的基因型及荧光强度,非常直观;
适用范围:
特别适合样本数量超过1500个以上,位点数量比较少的SNP分型。
客户需要提供:
1. 细胞,组织或血液等样品材料,基因组DNA提取费用单独收费;
2. 基因组DNA(体积≥30μl,浓度≥50 ng/μl),纯度 OD260/280 为1.7~1.9之间;
3. 人类基因组需提供SNP位点的RS号。其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需提供SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它连锁位点。
最终提交结果:
1. SNPs结果(ExceL表格);
2. 完整实验报告:扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;