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固定化的胰蛋白酶 ( Immobilized Trypsin ) 提供了一种快速和简便的蛋白消化方式，它既能够消化一定浓度范围内的已纯化蛋白，也可以消化复杂的蛋白混合物。消化后的肽段可以很容易地从固定化的胰酶中分离，当它们流经离心柱后，便可进入收集管中。固定化的胰酶之所以易于从肽溶液中去除，是因为胰酶不能通过柱子上的过滤板。 胰酶是一种蛋白水解酶，在带正电的赖氨酸 (Lys) 和精氨酸 (Arg) 的羧基处剪切。当这些氨基酸后面为非极性的脯氨酸 (Pro) 的时候，该位点的消化效率不高。当赖氨酸和精氨酸后面为酸性氨基酸 ( 天冬氨酸 (Asp) 和谷氨酸 (Glu) ) 的时候，消化效率也不高。