组分 装量
Taq DNA 聚合酶(5U/μl):100μl
10×标准Taq反应缓冲液:1.5ml×2
概述:Taq DNA聚合酶是一种耐热聚合酶,该酶具有5´→3´聚合酶活性和双链特异性5´→3´核酸外切酶活性。该酶是PCR中应用最广泛的酶。为了便于各种PCR反应,标准Taq缓冲液不含有非离子变性剂,适用于要求无变性剂的反应的需要。
来源:来源于一种E.coli菌株,此菌株含有来源于Thermus aquaticus YT-1的Taq DNA聚合酶基因。
应用:常规PCR,微阵列分析,高通量PCR,DHPLC,菌落PCR。
贮存溶液:20 mM
Tris-HCl (pH 8.0 @ 25 °C),100 mM KCl,0.1 mM EDTA,1 mM DTT,0.5% Tween 20,0.5% NP-40和50%甘油(V/V)。
反应缓冲液:(随酶提供) 10×标准Taq反应缓冲液。
反应条件:100 μl的反应体系含:1×标准Taq反应缓冲液,DNA模板,引物,200 μM dNTPs和2-5 U的聚合酶。
1×标准Taq反应缓冲液:10 mM
Tris-HCl (pH 8.3 @ 25 °C),50 mM KCl,1.5 mM MgCl2。
单位定义:1单位指75°C条件下反应30分钟,能使10 nmol的dNTPs掺入酸不溶性沉淀物所需要的酶量。
活性检测条件:1×标准Taq反应缓冲液,每种dNTP (包括[3H]-dNTP) 各200 μM以及200 μg/ml的活化小牛胸腺DNA。
热失活条件:无。
质量控制检测:
5 kb Lambda PCR:以5 ng Lambda DNA为模板,在1×标准Taq反应缓冲液中加入200 μM
dNTPs、0.2 μM引物和2.5 U的聚合酶进行PCR扩增25个循环,获得5 kb特异性产物100 ng。
核酸内切酶活性:50 μl反应体系中,20 U本酶与1 μg的pUC19质粒于37°C下温育4小时,DNA的电泳条带无明显变化。
PCR应用指南:
Taq DNA聚合酶广泛的应用于聚合酶链式反应 (PCR) 的一种聚合酶,以下的建议可基本确保该酶成功地完成PCR反应。这些建议涵盖了常规的PCR反应。富含GC模板、有二级结构的模板、低模板浓度以及扩增超过5 kb以上模板时,需要相应的调整反应条件。
1. DNA模板:以高质量、纯化后的DNA模板可以提高PCR反应成功的几率,而避免之前相关PCR反应的污染也非常关键。一般而言,在进行25-30轮循环后,要检测到产物,需要大约104拷贝数的目的DNA。也就是说需要终浓度为0.1 ng/ml的质粒病毒DNA,1-10 μg/ml的基因组DNA。
2.引物:寡核苷酸引物的长度一般为20-30 bp,理想的GC含量应为40-60%,并且平均的分布在引物中。理论退火温度一般是在42-65°C之间,两引物的退火温度相差应在5°C以内。引物内不能存在二级结构,如发夹结构,两引物之间不能互补,以防出现引物二聚体而减少产量。有很多软件都可以设计出合适的引物。一个典型的PCR反应中,引物的浓度应约为0.1-0.5 μM。
3. Mg2+浓度:大多数使用Taq DNA聚合酶的PCR反应,最适Mg2+浓度一般为1.5-2.0 mM。可以用0.5或1.0 mM递增浓度来确定最适Mg2+浓度。
4. dNTPs:每种dNTPs的浓度一般都为200 μM。
5. Taq DNA聚合酶:PCR反应体系中Taq DNA聚合酶的终浓度一般是20 U/ml。但在进行特异性扩增时,可用5-50 U/ml的用量。
6. 起始反应:反应开始以及在第一轮热循环时,非特异性链的合成,是一些PCR反应中产生非预期产物的原因,这种现象可以通过以下步骤来避免:所有的反应成分都应置于冰上,且添加反应成分亦需在冰上操作,最后加入聚合酶,并立即将反应体系置于已预热至变性温度
(94°C) 的扩增仪中。
7. 变性温度与时间:为使DNA完全变性,PCR循环前,起始变性温度通常为94°C。热循环中DNA要在94°C有15-30秒的变性,这也依赖于所使用的扩增仪及PCR管。根据扩增仪的相关资料,来确定是否需要增加特异的反应步骤。
8. 退火温度与时间:通常,退火温度的选择需与引物的Tm值相匹配,一般在55-60°C之间。15-30秒的退火时间是比较合适的。
9. 延伸时间:延伸反应通常为72°C,一般而言,每合成1000 bp需要一分钟,当延伸长度小于1 kb时,需要的时间为45-60秒。
Taq PCR反应体系
以λ DNA为模板进行PCR扩增反应
1. 按下列组份配制PCR反应液。
Taq (5 U/μl) 0.25-0.5μl
10× PCR Buffer (Mg2+ Plus) 5μl
dNTP Mixture (各2.5 mM)a 4μl
模板DNA (λ DNA)b 2.5 ng
引物1 (10 μM) 2μl
引物2 (10 μM) 2μl
水 至50μl
[a]:如果使用dNTP Mixture (各10 mM),则50 μl PCR体系的加入量为1μl
[b]:50 μl PCR反应体系中模板DNA推荐使用量
人基因组DNA 0.1μg-1μg
大肠杆菌基因组DNA 10ng-100ng
λ DNA 0.5ng-5ng
质粒DNA 0.1ng-10ng